芝士应该密封冷藏保存，并且在两个星期内食用完毕。 新鲜芝士，如农家芝士和稀奶油干酪的水分都比较高，因此它们比质地较紧密的芝士(契达、高达)更容易腐败。
不同类型的芝士在保存时也要区别对待，比如新鲜、软质的奶酪水分含量较高，应该冷藏并尽快食用。
硬质奶酪应该在磨碎后放入密封的容器中冷藏，如需储存较长时间则需要冷冻。
香气浓郁的芝士需要密封包装，避免其味道扩散。
