甲午战后，积极支持并参与维新活动。在京任职期间结识了康有为、梁启超等，并把梁介绍给当时陕西积极宣传西方民主与科学思想的刘古愚。他还为黄遵宪、汪康年等创办的《时务报》募收捐款，积极协助报馆推销报纸，为宣传维新变法做出了贡献。戊戌变法期间，他始终与康、梁和严复等维新派保持联系；经常往来于光绪帝与维新志士之间，使维新派的新政建议迅速上达，将光绪帝的意图转告维新派，还将中枢的机密情报透露给在天津主办《国闻报》的严复，使支持和同情变法的官僚士大夫们了解中枢动向。他积极条陈新政事宜，曾向光绪帝上奏，请求废除三跪九拜等繁缛礼仪，裁汰各官僚机构中的冗官冗员，撤除或合并翰林院、詹事府等闲散衙门，精简中枢重叠的办事机梗唤ㄒ榍逋⑴稍钡轿鞣?国家购买西服，以取代长袍马褂。光绪帝肯定了他的建议，并准备秘密派使臣到西方国家购买西服。但此举受到慈禧与守旧官僚的攻击，咒骂李是“汉奸”，企图“用夷变夏”。
二十四年（1898）正月与宋伯鲁等创立关学会于京师；八月，戊戌变法失败，以慈禧为首的顽固守旧势力幽禁光绪帝，并下令大肆搜捕维新人士。李闻知消息，急忙通知宋伯鲁和其他维新派人士从京师逃走，他自己也躲入意大利驻华公使馆避难。由于外国公使干预，李才免遭杀身之祸，但受到严厉处分，清廷降旨对他“革职永不叙用，并拿问”。同年回到陕西，暗地里仍与一些讲求新学的进步知识分子来往，坚持同顽固腐朽势力进行斗争。三十一年（1905）秋去上海，应好友张元济之邀，到商务印书馆任编辑，一度还在中国公学兼授国文课程。在此期间，与康有为、梁启超等人仍有书信来往，还与梁启超合著《中国六大政治家》一书。他的著作《春冰室野乘》《郢云词集》和《国史读本》等也于此时出版。
辛亥革命后，受北京政府邀请，赴京担任清史馆编修，撰写了不少列传、记事。1915年后，还给《甲寅》杂志等报刊撰写评论文章。1922年回到西安，名义上是陕西省长公署秘书长及督办公署秘书，实际上没有做过什么事情。后应邀主编咸阳县志，但始终未能动笔。由于政治上失意，晚年思想消沉，后又染上鸦片烟瘾，1927年去世。
晚寒酽、沈云罥网，细雨微缬。帘际酸风乍掣。霏花渐酿暮雪。
记昨夜、星辰前夜月。小楼畔、绿酒香冽。怅赠佩、传笺俊游侣，今宵惇轻别。
思结。梦中翠管凄咽。念雾鬓、烟鬟惊鸿态，楚楚清露怯。
嗟凤思鸾愁，都付啼鴂。怨歌断阕留泪痕，看取斑斑泪血。
瀛海尘飞红桑折。银云浦、暗停画楫。旧盟稳、瑶缄回荩箧。
在天愿、比翼鹣鹣万籁寂。灵犀肯向笼鹦泄。
倦调凤柱，回梦鸳机，难驻归燕。黛笔双蛾，曾记镜中回面。
啼鴂生憎芳讯渺，惊鸿却悔神光见。怅重来，但苔痕印屧，蜡珠萦剪。
甚昨夕、星辰凄怨。门外香骢，陌上踏遍。秀靥秋眸，无恙旧时行看。
风意不应迷路迥，云罗翻界微波远。黯凭阑，听箫声、晕蟾吹散。
春声夜来四起，遍千门万户。碧天远、玉宇高寒，珊珊明月何暮。
御街畔、鱼龙曼衍，星桥铁锁银花树。漾晴晖、摇曳因风，荡成芳絮。
旧日东华，几辈胜侣，踏天街软雾。醉箫鼓、游宴承平，京尘缁尽衣素。
蓦惊心、天吴蹴浪，彩云散、飘零金缕。怕重论、青琐朝班，旧时鹓鹭。
金舆北曲，紫气西来，九重尚寄旅。闻说道、帝城无恙，昨梦依稀，北里笙歌，南湖烟雨。
灵均顑颔，兰成萧瑟，支离东北风尘际，最销魂、一曲公无渡。
钗分镜拆，凄然更怆离鸾，玉颜寂寞黄土。
茫茫万感，漫鼓秦筝，听夜歌白苎。试问取、余情何似，江上烟云，梦蝶逍遥，听鸡起舞。
沅湘难济，重华何在，瑶台娀女方偃蹇，莽风涛、谁是中流柱。
江南草长莺飞，招隐词成，故人在否。
洞箫声暖。冶游到、回廊小院。听多少、莺歌燕语，忘却秋来旧怨。
望家山、难卜归期，天涯输与飞雁。但凤纸传笺，貂裘贳酒，夜走燕支坡畔。
曾记得，年时事，行乐地、月明花满。春光能几日，蜂狂蝶闹，东风蓦地轻吹散。
故园凝盼。碧沈沈、燕草秦桑，一纸音书断。杨花去也，愁问江南近远。
峭寒侧。帘外东风无力。清明近、烟柳雨丝，空里冥濛弄娇碧。
春来似过客。寂寂。箫声巷陌。谁曾信、无限古欢，一霎鹃声变今昔。
伤心判鹣翼。但想像玉容，眉恨堆积。天长地久情何极。
记花下携手，落红黏鬓，珍丛静绕数太息。怕芳事狼藉。
追忆。更悽恻。但永夜无眠，零泪沾臆。安仁鬓影新霜白。
纵月没星替，那能销释。梁閒栖燕，定为我，也脉脉。
娇柳青柔，小桃红晕，嫩寒天气。午梦回、独自凭阑，蝶影泥人，庭院绿阴如水。
寂寞锦衾孤眠久，倚虚幌、凝眸曾倦睇。销魂极。剩尘掩镜奁，箱封针黹。
春来最伤往事。况梁燕、双栖莺语腻。对画楼遗挂，人閒天上，音容迢递。
薄命似花愁轻折，更帘外、东风红满地。春残矣。纵芳醑、应难成醉。
芳事阑珊极。更何堪、几番风雨，几番摧抑。似绣园林谁管领，祗恨长幡无力。
但一任、封姨狼藉。零落国香无人问，剩浮花、浪蕊争春色。
鹃啼苦，落英积。
玉箫声里流年掷。遍天涯、濛濛飞絮，绿愁红恻。沧海沈沈碧云暮，梦里难忘故国。
问谁侍、东皇案侧。陶令门前垂垂柳，折腰支、移傍章台植。
阑干外，月华白。
记年时、月明仙掌，北风吹尔南去。悤悤几日春回矣，还到旧曾经处。
君且住。君不见、青芜满目迷归路。黯然无语。尽咄咄书空，一行行字，为问甚情绪。
閒凝伫。似悔随阳计误。惊心矰缴无数。小园却羡閒莺燕，梦稳画梁芳树。
君记取。休忘却、莓苔菰米湘江渚。今宵送汝。便一舸江南，春帆万里，相觅旧鸥鹭。
彩云化也，今生已矣，那问他生。不信春宵苦短，尽厌厌、守定残更。
记年时、银烛坐调笙。甚今年、一样东风到，引琼箫、都作离声。
堕砌缴云冉冉，窥窗淡月冥冥。肠断哀蝉落叶，昙花絮果，了不分明。
一霎鸳鸯梦醒。但悽然、镜约钗盟。算人閒、天上两凄清。
便相逢、梦里浑无据，况不眠、梦也难成。帖帖蚕眠细字，昏昏凤胫孤镫。
